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Table 1 Spoligotype shared types for the 260M. tuberculosis strains evaluated in this study.

From: Genetic diversity of Mycobacterium tuberculosis isolates from Beijing, China assessed by Spoligotyping, LSPs and VNTR profiles

SIT na Spoligotype description binary SpolDB4 IDb No.c Prevalence (%)d
1 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ Beijing 197 77.3%
53 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T1 18 6.92%
190 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ Beijing 5 1.92%
52 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ T2 5 1.92%
  ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ New 4 0.3%
154 ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T1 3 1.15%
1364 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■□□ ■ ■ ■ ■ Beijing 2 0.77%
269 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ Beijing-like 2 0.77%
917 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T1 2 0.77%
1688 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T1 2 0.6%
73 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ T2-T3 2 0.77%
632 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■ Beijing 1 0.38%
  □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■□□□ ■ ■ ■ New(Beijing?) 1 0.38%
255 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ Beijing 1 0.38%
  □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■□□□□□□□ New(Beijing?) 1 0.38%
1311 □□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ U 1 0.38%
  ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ New 1 0.38%
  ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ New 1 0.38%
1163 ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T3 1 0.38%
  ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ New 1 0.38% 5
  ■ ■ ■ ■ ■□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ New 1 0.38%
  ■ ■ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ New 1 0.38%
500 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T1 1 0.38%
  ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ Nwe 1 0.38%
  ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□ U 1 0.38%
1580 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ T1 1 0.38%
  ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■□ ■ ■ ■ New 1 0.38%
  ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□ ■□□ ■ ■ ■ ■ ■□□□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ New 1 0.38%
54 ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■□□ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ ■ MANU2 1 0.38%
  1. a SIT from SpolDB4.0.
  2. b Representing spoligotype families as assigned in SpolDB4.0.
  3. c Number of isolates with a common SIT.
  4. d Prevalence represents the number of isolates with a common SIT relative to the total number of isolates in this study.